Un plasmide ApE- Editor
Pour tous les utilisateurs Mac: Le bug Mac provoque un scintillement se bloquer lors de l'ouverture de plusieurs fichiers doit être fixé dans cette dernière version (2.0.51). Faites-moi savoir si vous rencontrez le moindre problème.
Gatekeeper fera rapport que l'application est endommagée et empêchera ApE de courir.
Vous devez aller dans Préférences Système> Sécurité et confidentialité> Général.
Cochez la case « Autoriser le logiciel téléchargé à partir n'importe où » pour permettre ApE à courir.
Appearntly, faites un clic droit sur ApE et sélectionnez « Open » ne fonctionnera pas pour contourner Gatekeeper sur tous les systèmes.
Ou utiliser une fonction de ligne de commande pour modifier les attributs de quarantaine.
- carte du texte montre la séquence d'ADN, la traduction, et propose sous forme de graphiques à base de texte
- restriction virtuelle digest
- Dessine des échelles d'ADN prédéfinies et définies par l'utilisateur
- Relie bandes au texte en double-clic
- Lit les fichiers de trace de séquençage ABI
- Les séquences ABI en traces peuvent être alignées directement à une séquence de référence, l'alignement des hyperliens retour à te trace.
Autres caractéristiques:
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Vous pouvez désormais exporter les régions génomiques de WormBase directement: Dans le bouton de menu déroulant en haut à droite, sélectionnez « Télécharger Track Data ». Cliquez sur le bouton « Configurer. ». Dump fonctions sélectionnées en utilisant la version 3 à travers la région actuellement visible. Cochez la case « Enregistrer dans un fichier ». Cochez la case « séquence d'ADN Intégrer ». Décochez la case « Inclure les données de configuration de la piste ». Cliquez sur "Go". Ouvrez le fichier .gff résultant dans le dernier ApE.
Vous pouvez également exporter une région génomique (à partir du visualiseur génome) sous forme de fichier au format FASTA (en utilisant le menu en haut à gauche). Vous pouvez ajouter les pistes de fonctionnalités en téléchargeant les fichiers de piste d'entités GFF3 en utilisant le même menu. Dans ApE, ouvrez le fichier FASTA, puis utilisez le menu Fonctions pour ouvrir les informations de piste GFF3.
Une autre façon de faire est de prendre le modèle de gène (à partir d'une page gène), collez-le dans une fenêtre ApE puis tout sélectionner, faire une nouvelle fonctionnalité (menu Feature), et dans la fenêtre de fonction d'édition qui apparaît, appuyez sur la « majuscule que le bouton ».
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